Организации, покупающие имущество, работы или услуги за счет бюджетных средств, не имеют права принять к вычету входной НДС в соответствии с пунктом 2.1 статьи 170 НК РФ.

Если деньги из бюджета израсходованы на оплату не всей покупки, а только ее части, запрет на вычет НДС распространяется не на весь входной налог, а только на его долю. Эта доля пропорциональна той части покупки, которая оплачена бюджетными деньгами.

При расчете пропорции нужно учитывать входной НДС в стоимости покупки. Кстати, это же правило распространяется и на покупку импортных товаров.

С 1 января 2019 года раздельный учет НДС не играет никакой роли. Весь налог, не принятый к вычету, нужно учитывать в прочих расходах, связанных с производством и реализацией, а не в стоимости покупки. Кроме того, в документах на предоставление субсидий или инвестиций разрешена оговорка, что бюджетные средства не идут на оплату входного НДС.

Речь идет о ситуации, когда бюджетными деньгами оплачивают стоимость товаров, работ или услуг без учета НДС, а НДС – из собственных денег. В этом случае можно принять входной НДС к вычету.

Что касается восстановления НДС. С 1 января 2019 года НДС необходимо восстановить, если бюджетные средства были выданы, в том числе, на оплату входного НДС. Это должно быть прописано в документах на предоставление денег из бюджета. Если субсидия не покрывает налог, его можно не восстанавливать. А вот если субсидия предоставлена исключительно для возмещения «импортного» НДС, импортер обязан восстановить НДС, ранее принятый к вычету. Если покупка была совершена за счет собственных средств, а потом ее стоимость частично компенсировало государство, то восстанавливают часть входного НДС в доле, пропорциональной возмещенной части покупки (без учета входного НДС).

С 2019 года расчет пропорции меняется – в стоимости покупки придется учитывать входной НДС. Поправки действуют в случаях, когда бюджетные средства получены в 2019 году и позже.

Изменения внесены в главу 21 «НДС» Налогового кодекса Федеральным законом от 27.11.2018№ 424-ФЗ.